Un Conclave lunghissimo: dall’1 dicembre 1799 al 14 marzo 1800, allorché i trentasei Cardinali presenti (su quarantacinque) elessero il sessantenne Chiaramonti. Anche la sua incoronazione si fece in Venezia, nella chiesa di San Giorgio Maggiore, perché l’imperatore Francesco aveva posto il veto su San Marco.
Entrato poi in conflitto con Napoleone (dopo essere stato convocato nel 1804 come spettatore della sua incoronazione a Parigi) nel luglio 1809 Pio VII venne «rapito» in Vaticano da gendarmi francesi. Tenuto dapprima prigioniero a Savona, e poi confinato in Francia, a Fontainebleau, fino al 1814 (sconfitta di Napoleone a Lipsia e prima abdicazione).
Tornato a Roma, vi accolse poi la madre dell’Imperatore relegato a Sant’Elena. Morì il 30 agosto 1823, mentre un incendio devastava l’antica basilica romana di San Paolo Fuori le Mura. Ma la notizia gli fu tenuta nascosta.